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我国大部分马地方品种，都是在各种特定的生态条件下，经长期培育而成，是我国极其丰富的遗传资源。它们共同的优点是体质健壮、耐粗饲、能适应当地的自然条件和社会经济条件。但是，它们的选择程度较低群体的外貌，体尺，性能等都不一致，参差不齐。为了保持该品种的优良特性，又要客服它的缺点，就可以采取本品种选育的方法，如三河马通过组织核心群，选择优良公马，进行个体选配和加强后代培育等有计划的选育工作，1955年时公马平均体高153厘米，而到20世纪70年代，公马体高已超过160厘米，河曲马1969年公马体高140厘米左右，1982年提高至145厘米。其他如哈萨克马通过本品种选育都有较大提高。
另一种选配是异质选配，即选择具有不同性状的公母马交配，以期将两个性状结合在一起，从而获得兼有双亲不同优点的后代，或者选择同一性状但优劣程度不同的公母马交配，以良好的性状纠正不良性状，使后代获得较大改进和提高。例如：用、公马与二级、三级母马交配。但不能用凸腰的公马与凹腰的母马交配。
矮马现在的数量相对来说是比较少的，有些地区的矮马甚至面临着绝迹的危险，这对于矮马的发展是不利的，造成这种情况的原因是多的， 一方面是养殖矮马的场所的减少，上世纪由于机械化大发展，像矮马这样的用于农业生产的马匹的需求量的减少，使得马匹整体的数量在不断的减少，不用说像矮马这种本来数量就不多的马种，随着养马场的增多，矮马的繁殖数量的提高，才逐渐的增多，另一方面都讲究民以食为天，饲料对于矮马来说也是同样要的，矮马的养殖要求是比较高的，需要精心的照料，喂养是如此，矮马通常是以粗料、植物秸秆、青草、猪潲为主食，少补给精料，个体矮马营养中等属正常，有利爬山涉水，有助速力、耐力及弹跳，现在的养马场对于矮马的饲料的控制都是严格的，矮马的饮食不良，就可能导致许多的问题，通常来说矮马的肠道是比较长的，主要是用于矮马对于草料的消化，如果喂食不良可能就会导致马匹的肠道打结，危及到生命，现在的一些养马场对于马匹的喂养都是科学的，有一套自己的营养配方和科学的方法。
